Les techniques

Les empreintes chimiques de chaque station de prélèvement seront établies pour les eaux de surface, le périphyton et le sédiment, en mobilisant des analyses chimiques ciblées couvrant une large gamme de substances (pesticides, substances pharmaceutiques incluant des antibiotiques, éléments traces métalliques, PFAs).

Les approches de metabarcoding seront réalisées à partir de l’ADNe microbien afin d’appréhender la structure et la diversité des communautés bactériennes (périphyton et sédiment), algales (périphyton) et de diatomées (périphyton).

Les approches PICT seront appliquées aux communautés microbiennes périphytiques et du sédiment en considérant des substances modèles représentatives de différentes classes de contaminants (incluant a minima un herbicide inhibiteur de la photosynthèse, le glyphosate, le cuivre, un antibiotique sulfamide, un anti-inflammatoire non stéroïdien et un bêta-bloquant) à partir de tests de toxicité ciblant les micro-organismes hétérotrophes et/ou phototrophes (suivant les substances et leurs effets toxiques, et le compartiment considéré).